Den första incidenten inträffade tidigt på torsdagsmorgonen, vid klockan 05.15.
Det handlade om ett signalfel mellan Arlanda/Märsta och Knivsta som gav förseningar och inställda avgångar.
Bland annat påverkades fjärr- och regionaltåg från Stockholm och norrut, däribland avgångar mot Gävle och Sundsvall.
Reparatörer anlände till platsen vid 05.45 på morgonen och vid 09.20-tiden meddelade Trafikverket att felet var åtgärdat – men vid 09.35-tiden kom felet tillbaka.
Det ska ha skett en kopparstöld och det omfattande felet gör att inga tåg nu kan passera förbi Uppsala.
Enligt Trafikverkets prognos kommer felet att vara åtgärdat vid 16.30 på torsdagen.
Vid 17-tiden ser det ut som att tågen går som de ska igen.
Håll koll på Trafikverkets hemsida.